Protein–RNA interactions for Protein: P01594

IGKV1-33, Immunoglobulin kappa variable 1-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-33P01594 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV1-33P01594 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV1-33P01594 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV1-33P01594 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV1-33P01594 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV1-33P01594 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV1-33P01594 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV1-33P01594 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV1-33P01594 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV1-33P01594 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV1-33P01594 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV1-33P01594 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV1-33P01594 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGKV1-33P01594 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1-33P01594 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-33P01594 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms