Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
OTCP00480 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
OTCP00480 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
OTCP00480 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTCP00480 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTCP00480 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTCP00480 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTCP00480 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTCP00480 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTCP00480 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTCP00480 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTCP00480 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTCP00480 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTCP00480 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTCP00480 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTCP00480 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTCP00480 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTCP00480 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTCP00480 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTCP00480 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTCP00480 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTCP00480 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTCP00480 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTCP00480 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTCP00480 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTCP00480 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTCP00480 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTCP00480 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTCP00480 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTCP00480 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTCP00480 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTCP00480 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTCP00480 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTCP00480 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTCP00480 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTCP00480 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTCP00480 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTCP00480 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTCP00480 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
OTCP00480 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTCP00480 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTCP00480 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTCP00480 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
OTCP00480 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTCP00480 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTCP00480 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTCP00480 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTCP00480 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTCP00480 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTCP00480 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTCP00480 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTCP00480 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTCP00480 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTCP00480 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTCP00480 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTCP00480 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTCP00480 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTCP00480 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTCP00480 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
OTCP00480 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTCP00480 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTCP00480 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTCP00480 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTCP00480 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTCP00480 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTCP00480 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTCP00480 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTCP00480 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
OTCP00480 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
OTCP00480 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTCP00480 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTCP00480 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTCP00480 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTCP00480 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTCP00480 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTCP00480 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTCP00480 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTCP00480 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTCP00480 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTCP00480 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
OTCP00480 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
OTCP00480 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
OTCP00480 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTCP00480 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTCP00480 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTCP00480 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTCP00480 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTCP00480 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTCP00480 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTCP00480 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTCP00480 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTCP00480 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTCP00480 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTCP00480 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTCP00480 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTCP00480 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTCP00480 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTCP00480 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTCP00480 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTCP00480 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms