Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF6BO95407 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF6BO95407 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF6BO95407 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms