Protein–RNA interactions for Protein: O95257

GADD45G, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GO95257 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GO95257 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GADD45GO95257 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GADD45GO95257 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GADD45GO95257 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GO95257 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GO95257 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GO95257 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GO95257 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GADD45GO95257 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GO95257 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GO95257 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GO95257 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GADD45GO95257 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms