Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOL3O95236 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOL3O95236 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOL3O95236 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOL3O95236 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOL3O95236 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOL3O95236 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOL3O95236 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOL3O95236 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOL3O95236 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOL3O95236 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOL3O95236 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOL3O95236 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOL3O95236 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOL3O95236 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOL3O95236 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOL3O95236 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOL3O95236 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOL3O95236 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOL3O95236 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOL3O95236 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOL3O95236 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOL3O95236 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOL3O95236 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOL3O95236 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOL3O95236 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOL3O95236 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOL3O95236 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOL3O95236 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOL3O95236 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOL3O95236 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOL3O95236 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL3O95236 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL3O95236 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL3O95236 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL3O95236 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APOL3O95236 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOL3O95236 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOL3O95236 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOL3O95236 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOL3O95236 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOL3O95236 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOL3O95236 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOL3O95236 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOL3O95236 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOL3O95236 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOL3O95236 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOL3O95236 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOL3O95236 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOL3O95236 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOL3O95236 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOL3O95236 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOL3O95236 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOL3O95236 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOL3O95236 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOL3O95236 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOL3O95236 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOL3O95236 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOL3O95236 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOL3O95236 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOL3O95236 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOL3O95236 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOL3O95236 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOL3O95236 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOL3O95236 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOL3O95236 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOL3O95236 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOL3O95236 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOL3O95236 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOL3O95236 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOL3O95236 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOL3O95236 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOL3O95236 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOL3O95236 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOL3O95236 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOL3O95236 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL3O95236 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL3O95236 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOL3O95236 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOL3O95236 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL3O95236 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL3O95236 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL3O95236 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL3O95236 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL3O95236 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL3O95236 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL3O95236 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL3O95236 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL3O95236 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOL3O95236 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOL3O95236 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOL3O95236 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOL3O95236 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOL3O95236 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APOL3O95236 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOL3O95236 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL3O95236 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL3O95236 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL3O95236 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOL3O95236 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms