Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE4BO95155 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE4BO95155 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE4BO95155 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms