Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
UFL1O94874 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UFL1O94874 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UFL1O94874 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
UFL1O94874 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UFL1O94874 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
UFL1O94874 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
UFL1O94874 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
UFL1O94874 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
UFL1O94874 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
UFL1O94874 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
UFL1O94874 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
UFL1O94874 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
UFL1O94874 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UFL1O94874 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UFL1O94874 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UFL1O94874 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UFL1O94874 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UFL1O94874 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UFL1O94874 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
UFL1O94874 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
UFL1O94874 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UFL1O94874 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
UFL1O94874 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
UFL1O94874 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
UFL1O94874 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
UFL1O94874 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
UFL1O94874 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
UFL1O94874 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
UFL1O94874 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UFL1O94874 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UFL1O94874 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UFL1O94874 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
UFL1O94874 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
UFL1O94874 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
UFL1O94874 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UFL1O94874 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
UFL1O94874 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UFL1O94874 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UFL1O94874 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
UFL1O94874 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
UFL1O94874 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
UFL1O94874 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UFL1O94874 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UFL1O94874 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
UFL1O94874 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UFL1O94874 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
UFL1O94874 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
UFL1O94874 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
UFL1O94874 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
UFL1O94874 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
UFL1O94874 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
UFL1O94874 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UFL1O94874 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UFL1O94874 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UFL1O94874 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UFL1O94874 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
UFL1O94874 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UFL1O94874 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
UFL1O94874 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UFL1O94874 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UFL1O94874 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UFL1O94874 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
UFL1O94874 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UFL1O94874 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UFL1O94874 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UFL1O94874 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
UFL1O94874 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UFL1O94874 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UFL1O94874 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UFL1O94874 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UFL1O94874 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UFL1O94874 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
UFL1O94874 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
UFL1O94874 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
UFL1O94874 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
UFL1O94874 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UFL1O94874 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UFL1O94874 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UFL1O94874 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UFL1O94874 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
UFL1O94874 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
UFL1O94874 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
UFL1O94874 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
UFL1O94874 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
UFL1O94874 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
UFL1O94874 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UFL1O94874 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
UFL1O94874 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
UFL1O94874 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UFL1O94874 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
UFL1O94874 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
UFL1O94874 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
UFL1O94874 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UFL1O94874 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
UFL1O94874 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UFL1O94874 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
UFL1O94874 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
UFL1O94874 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
UFL1O94874 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms