Protein–RNA interactions for Protein: O75764

TCEA3, Transcription elongation factor A protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA3O75764 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCEA3O75764 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCEA3O75764 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCEA3O75764 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCEA3O75764 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCEA3O75764 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCEA3O75764 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCEA3O75764 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCEA3O75764 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCEA3O75764 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCEA3O75764 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEA3O75764 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms