Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA10O75578 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA10O75578 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA10O75578 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA10O75578 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA10O75578 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms