Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F6O75461 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F6O75461 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F6O75461 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F6O75461 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F6O75461 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F6O75461 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2F6O75461 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F6O75461 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F6O75461 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F6O75461 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F6O75461 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F6O75461 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F6O75461 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F6O75461 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F6O75461 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F6O75461 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F6O75461 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F6O75461 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F6O75461 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F6O75461 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F6O75461 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F6O75461 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F6O75461 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F6O75461 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F6O75461 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F6O75461 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F6O75461 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F6O75461 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
E2F6O75461 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F6O75461 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F6O75461 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F6O75461 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F6O75461 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F6O75461 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F6O75461 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F6O75461 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F6O75461 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F6O75461 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F6O75461 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F6O75461 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F6O75461 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F6O75461 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F6O75461 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F6O75461 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F6O75461 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F6O75461 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F6O75461 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F6O75461 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F6O75461 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F6O75461 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F6O75461 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F6O75461 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F6O75461 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F6O75461 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F6O75461 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F6O75461 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F6O75461 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F6O75461 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F6O75461 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F6O75461 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F6O75461 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F6O75461 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F6O75461 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F6O75461 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F6O75461 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F6O75461 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F6O75461 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F6O75461 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F6O75461 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F6O75461 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F6O75461 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F6O75461 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F6O75461 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F6O75461 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F6O75461 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F6O75461 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F6O75461 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F6O75461 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F6O75461 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F6O75461 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F6O75461 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F6O75461 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F6O75461 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F6O75461 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F6O75461 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F6O75461 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F6O75461 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F6O75461 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F6O75461 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F6O75461 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F6O75461 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F6O75461 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F6O75461 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F6O75461 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F6O75461 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F6O75461 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F6O75461 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F6O75461 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F6O75461 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms