Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP9AO75110 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP9AO75110 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP9AO75110 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms