Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM20BO75063 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20BO75063 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM20BO75063 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM20BO75063 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8285.1 ms