Protein–RNA interactions for Protein: O60869

EDF1, Endothelial differentiation-related factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDF1O60869 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDF1O60869 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDF1O60869 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDF1O60869 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDF1O60869 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDF1O60869 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDF1O60869 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDF1O60869 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDF1O60869 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDF1O60869 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDF1O60869 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDF1O60869 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDF1O60869 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDF1O60869 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDF1O60869 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDF1O60869 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDF1O60869 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDF1O60869 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDF1O60869 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDF1O60869 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EDF1O60869 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EDF1O60869 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDF1O60869 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDF1O60869 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDF1O60869 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDF1O60869 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDF1O60869 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EDF1O60869 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDF1O60869 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDF1O60869 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDF1O60869 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDF1O60869 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EDF1O60869 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDF1O60869 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDF1O60869 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDF1O60869 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDF1O60869 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDF1O60869 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDF1O60869 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDF1O60869 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDF1O60869 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDF1O60869 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDF1O60869 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDF1O60869 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDF1O60869 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDF1O60869 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDF1O60869 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDF1O60869 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDF1O60869 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDF1O60869 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDF1O60869 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDF1O60869 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDF1O60869 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDF1O60869 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDF1O60869 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDF1O60869 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDF1O60869 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDF1O60869 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDF1O60869 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDF1O60869 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EDF1O60869 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDF1O60869 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDF1O60869 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDF1O60869 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDF1O60869 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDF1O60869 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EDF1O60869 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDF1O60869 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDF1O60869 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDF1O60869 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDF1O60869 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDF1O60869 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDF1O60869 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDF1O60869 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDF1O60869 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDF1O60869 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDF1O60869 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDF1O60869 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDF1O60869 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDF1O60869 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDF1O60869 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDF1O60869 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDF1O60869 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDF1O60869 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDF1O60869 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDF1O60869 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDF1O60869 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDF1O60869 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EDF1O60869 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDF1O60869 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDF1O60869 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EDF1O60869 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDF1O60869 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EDF1O60869 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDF1O60869 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDF1O60869 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDF1O60869 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDF1O60869 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDF1O60869 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDF1O60869 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms