Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPGDSO60760 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HPGDSO60760 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HPGDSO60760 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPGDSO60760 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms