Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BNIP3LO60238 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BNIP3LO60238 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BNIP3LO60238 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BNIP3LO60238 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms