Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KALRNO60229 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KALRNO60229 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KALRNO60229 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KALRNO60229 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KALRNO60229 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KALRNO60229 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KALRNO60229 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KALRNO60229 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KALRNO60229 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KALRNO60229 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KALRNO60229 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KALRNO60229 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KALRNO60229 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KALRNO60229 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KALRNO60229 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KALRNO60229 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KALRNO60229 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KALRNO60229 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KALRNO60229 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KALRNO60229 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KALRNO60229 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KALRNO60229 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KALRNO60229 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KALRNO60229 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KALRNO60229 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KALRNO60229 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KALRNO60229 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KALRNO60229 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KALRNO60229 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KALRNO60229 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KALRNO60229 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KALRNO60229 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KALRNO60229 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KALRNO60229 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KALRNO60229 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KALRNO60229 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KALRNO60229 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KALRNO60229 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KALRNO60229 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KALRNO60229 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KALRNO60229 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
KALRNO60229 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KALRNO60229 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KALRNO60229 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KALRNO60229 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KALRNO60229 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KALRNO60229 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KALRNO60229 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KALRNO60229 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KALRNO60229 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KALRNO60229 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KALRNO60229 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KALRNO60229 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KALRNO60229 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KALRNO60229 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KALRNO60229 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KALRNO60229 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KALRNO60229 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KALRNO60229 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KALRNO60229 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KALRNO60229 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KALRNO60229 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KALRNO60229 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KALRNO60229 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KALRNO60229 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KALRNO60229 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KALRNO60229 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KALRNO60229 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KALRNO60229 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KALRNO60229 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KALRNO60229 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KALRNO60229 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KALRNO60229 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KALRNO60229 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KALRNO60229 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KALRNO60229 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KALRNO60229 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KALRNO60229 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KALRNO60229 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KALRNO60229 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KALRNO60229 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KALRNO60229 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KALRNO60229 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KALRNO60229 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KALRNO60229 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KALRNO60229 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KALRNO60229 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KALRNO60229 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KALRNO60229 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KALRNO60229 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KALRNO60229 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KALRNO60229 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KALRNO60229 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KALRNO60229 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KALRNO60229 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KALRNO60229 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KALRNO60229 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KALRNO60229 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KALRNO60229 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms