Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIREO43918 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIREO43918 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIREO43918 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AIREO43918 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIREO43918 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIREO43918 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIREO43918 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIREO43918 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIREO43918 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIREO43918 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIREO43918 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIREO43918 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIREO43918 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIREO43918 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AIREO43918 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AIREO43918 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AIREO43918 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AIREO43918 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AIREO43918 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AIREO43918 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AIREO43918 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AIREO43918 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AIREO43918 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AIREO43918 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AIREO43918 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AIREO43918 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AIREO43918 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AIREO43918 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIREO43918 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AIREO43918 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIREO43918 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIREO43918 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AIREO43918 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIREO43918 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIREO43918 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIREO43918 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIREO43918 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIREO43918 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIREO43918 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIREO43918 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIREO43918 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AIREO43918 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AIREO43918 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AIREO43918 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AIREO43918 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AIREO43918 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AIREO43918 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AIREO43918 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AIREO43918 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AIREO43918 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIREO43918 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIREO43918 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIREO43918 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIREO43918 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIREO43918 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIREO43918 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIREO43918 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIREO43918 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIREO43918 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIREO43918 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIREO43918 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIREO43918 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIREO43918 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIREO43918 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIREO43918 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIREO43918 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIREO43918 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIREO43918 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIREO43918 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIREO43918 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIREO43918 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIREO43918 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIREO43918 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIREO43918 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIREO43918 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIREO43918 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIREO43918 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIREO43918 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AIREO43918 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIREO43918 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIREO43918 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIREO43918 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIREO43918 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIREO43918 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIREO43918 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIREO43918 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIREO43918 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIREO43918 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIREO43918 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIREO43918 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIREO43918 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIREO43918 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIREO43918 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIREO43918 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIREO43918 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIREO43918 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIREO43918 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AIREO43918 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AIREO43918 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms