Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TIMM44O43615 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIMM44O43615 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIMM44O43615 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TIMM44O43615 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMM44O43615 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms