Protein–RNA interactions for Protein: O43561

LAT, Linker for activation of T-cells family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATO43561 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LATO43561 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LATO43561 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LATO43561 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LATO43561 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LATO43561 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LATO43561 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LATO43561 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LATO43561 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LATO43561 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LATO43561 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LATO43561 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LATO43561 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LATO43561 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LATO43561 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LATO43561 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LATO43561 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LATO43561 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LATO43561 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LATO43561 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LATO43561 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LATO43561 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LATO43561 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LATO43561 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LATO43561 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LATO43561 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LATO43561 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LATO43561 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LATO43561 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LATO43561 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LATO43561 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LATO43561 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LATO43561 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LATO43561 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LATO43561 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LATO43561 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LATO43561 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LATO43561 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LATO43561 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LATO43561 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LATO43561 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LATO43561 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LATO43561 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LATO43561 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LATO43561 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LATO43561 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LATO43561 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LATO43561 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LATO43561 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LATO43561 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LATO43561 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LATO43561 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LATO43561 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LATO43561 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LATO43561 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LATO43561 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LATO43561 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LATO43561 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LATO43561 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LATO43561 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LATO43561 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LATO43561 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LATO43561 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LATO43561 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LATO43561 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LATO43561 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LATO43561 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LATO43561 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LATO43561 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LATO43561 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LATO43561 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LATO43561 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LATO43561 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LATO43561 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LATO43561 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LATO43561 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LATO43561 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LATO43561 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LATO43561 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LATO43561 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LATO43561 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LATO43561 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LATO43561 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LATO43561 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LATO43561 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LATO43561 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LATO43561 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LATO43561 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LATO43561 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LATO43561 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LATO43561 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LATO43561 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LATO43561 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LATO43561 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LATO43561 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LATO43561 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LATO43561 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LATO43561 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LATO43561 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LATO43561 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms