Protein–RNA interactions for Protein: O43299

AP5Z1, AP-5 complex subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5Z1O43299 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AP5Z1O43299 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
AP5Z1O43299 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AP5Z1O43299 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AP5Z1O43299 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AP5Z1O43299 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
AP5Z1O43299 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AP5Z1O43299 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AP5Z1O43299 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AP5Z1O43299 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AP5Z1O43299 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AP5Z1O43299 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AP5Z1O43299 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AP5Z1O43299 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AP5Z1O43299 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AP5Z1O43299 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AP5Z1O43299 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AP5Z1O43299 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AP5Z1O43299 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AP5Z1O43299 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
AP5Z1O43299 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.52■■■□□ 2
AP5Z1O43299 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AP5Z1O43299 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AP5Z1O43299 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AP5Z1O43299 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AP5Z1O43299 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
AP5Z1O43299 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP5Z1O43299 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms