Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DYNC1LI2O43237 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DYNC1LI2O43237 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DYNC1LI2O43237 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DYNC1LI2O43237 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DYNC1LI2O43237 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DYNC1LI2O43237 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DYNC1LI2O43237 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DYNC1LI2O43237 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DYNC1LI2O43237 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms