Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP8O43159 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP8O43159 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP8O43159 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP8O43159 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP8O43159 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP8O43159 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP8O43159 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP8O43159 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP8O43159 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP8O43159 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP8O43159 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP8O43159 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP8O43159 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP8O43159 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP8O43159 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP8O43159 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP8O43159 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP8O43159 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP8O43159 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP8O43159 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP8O43159 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP8O43159 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP8O43159 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP8O43159 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP8O43159 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP8O43159 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP8O43159 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP8O43159 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP8O43159 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP8O43159 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP8O43159 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP8O43159 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP8O43159 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP8O43159 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP8O43159 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP8O43159 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP8O43159 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP8O43159 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP8O43159 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP8O43159 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP8O43159 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP8O43159 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP8O43159 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP8O43159 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP8O43159 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP8O43159 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP8O43159 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP8O43159 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP8O43159 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP8O43159 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP8O43159 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRP8O43159 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP8O43159 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP8O43159 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP8O43159 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP8O43159 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP8O43159 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP8O43159 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP8O43159 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP8O43159 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP8O43159 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP8O43159 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP8O43159 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP8O43159 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP8O43159 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP8O43159 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP8O43159 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP8O43159 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP8O43159 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP8O43159 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP8O43159 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP8O43159 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP8O43159 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP8O43159 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP8O43159 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP8O43159 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP8O43159 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP8O43159 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP8O43159 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP8O43159 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP8O43159 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP8O43159 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP8O43159 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP8O43159 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRP8O43159 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP8O43159 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP8O43159 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP8O43159 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP8O43159 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP8O43159 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP8O43159 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP8O43159 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP8O43159 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP8O43159 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP8O43159 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP8O43159 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP8O43159 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP8O43159 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP8O43159 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms