Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLDN3O15551 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN3O15551 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CLDN3O15551 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN3O15551 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms