Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARPC5O15511 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARPC5O15511 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARPC5O15511 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ARPC5O15511 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ARPC5O15511 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms