Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHADO15335 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHADO15335 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHADO15335 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHADO15335 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHADO15335 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHADO15335 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHADO15335 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHADO15335 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHADO15335 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHADO15335 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHADO15335 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHADO15335 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHADO15335 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHADO15335 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHADO15335 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHADO15335 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHADO15335 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHADO15335 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHADO15335 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHADO15335 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHADO15335 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHADO15335 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHADO15335 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHADO15335 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHADO15335 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHADO15335 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHADO15335 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHADO15335 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHADO15335 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHADO15335 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHADO15335 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHADO15335 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHADO15335 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHADO15335 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHADO15335 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHADO15335 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHADO15335 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHADO15335 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHADO15335 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHADO15335 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHADO15335 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHADO15335 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHADO15335 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHADO15335 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHADO15335 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHADO15335 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHADO15335 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHADO15335 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHADO15335 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHADO15335 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHADO15335 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHADO15335 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHADO15335 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHADO15335 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHADO15335 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHADO15335 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHADO15335 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHADO15335 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHADO15335 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHADO15335 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHADO15335 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHADO15335 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHADO15335 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHADO15335 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHADO15335 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CHADO15335 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHADO15335 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHADO15335 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHADO15335 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHADO15335 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHADO15335 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHADO15335 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHADO15335 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHADO15335 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHADO15335 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHADO15335 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHADO15335 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHADO15335 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHADO15335 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHADO15335 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHADO15335 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHADO15335 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHADO15335 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHADO15335 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHADO15335 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHADO15335 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHADO15335 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHADO15335 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHADO15335 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHADO15335 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHADO15335 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHADO15335 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHADO15335 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHADO15335 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHADO15335 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHADO15335 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHADO15335 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHADO15335 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHADO15335 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms