Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MATN3O15232 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MATN3O15232 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MATN3O15232 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MATN3O15232 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MATN3O15232 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MATN3O15232 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MATN3O15232 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MATN3O15232 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MATN3O15232 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MATN3O15232 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MATN3O15232 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MATN3O15232 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MATN3O15232 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MATN3O15232 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MATN3O15232 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MATN3O15232 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN3O15232 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN3O15232 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN3O15232 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN3O15232 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN3O15232 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN3O15232 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN3O15232 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MATN3O15232 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MATN3O15232 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN3O15232 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN3O15232 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN3O15232 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN3O15232 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN3O15232 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN3O15232 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MATN3O15232 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MATN3O15232 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MATN3O15232 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MATN3O15232 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MATN3O15232 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MATN3O15232 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MATN3O15232 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MATN3O15232 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MATN3O15232 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MATN3O15232 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MATN3O15232 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MATN3O15232 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MATN3O15232 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MATN3O15232 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MATN3O15232 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MATN3O15232 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MATN3O15232 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MATN3O15232 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MATN3O15232 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MATN3O15232 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MATN3O15232 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MATN3O15232 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MATN3O15232 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MATN3O15232 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MATN3O15232 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MATN3O15232 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MATN3O15232 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MATN3O15232 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MATN3O15232 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MATN3O15232 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MATN3O15232 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MATN3O15232 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MATN3O15232 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MATN3O15232 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MATN3O15232 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MATN3O15232 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MATN3O15232 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MATN3O15232 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MATN3O15232 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MATN3O15232 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MATN3O15232 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MATN3O15232 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MATN3O15232 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MATN3O15232 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MATN3O15232 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MATN3O15232 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MATN3O15232 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MATN3O15232 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MATN3O15232 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MATN3O15232 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MATN3O15232 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MATN3O15232 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MATN3O15232 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MATN3O15232 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MATN3O15232 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MATN3O15232 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MATN3O15232 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MATN3O15232 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MATN3O15232 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MATN3O15232 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MATN3O15232 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MATN3O15232 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MATN3O15232 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MATN3O15232 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MATN3O15232 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MATN3O15232 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MATN3O15232 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MATN3O15232 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms