Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2A1O14983 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2A1O14983 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP2A1O14983 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2A1O14983 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2A1O14983 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2A1O14983 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2A1O14983 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2A1O14983 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2A1O14983 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2A1O14983 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2A1O14983 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2A1O14983 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2A1O14983 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2A1O14983 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2A1O14983 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2A1O14983 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2A1O14983 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms