Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE40O14503 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHE40O14503 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BHLHE40O14503 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms