Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRPO00591 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRPO00591 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRPO00591 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRPO00591 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRPO00591 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRPO00591 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRPO00591 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRPO00591 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRPO00591 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRPO00591 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRPO00591 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRPO00591 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRPO00591 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRPO00591 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRPO00591 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRPO00591 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRPO00591 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRPO00591 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRPO00591 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRPO00591 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRPO00591 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRPO00591 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRPO00591 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRPO00591 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABRPO00591 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRPO00591 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRPO00591 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRPO00591 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRPO00591 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRPO00591 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRPO00591 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRPO00591 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRPO00591 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRPO00591 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRPO00591 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRPO00591 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRPO00591 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRPO00591 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRPO00591 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRPO00591 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRPO00591 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRPO00591 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRPO00591 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRPO00591 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRPO00591 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRPO00591 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRPO00591 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRPO00591 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRPO00591 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRPO00591 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRPO00591 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRPO00591 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRPO00591 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRPO00591 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRPO00591 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRPO00591 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRPO00591 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRPO00591 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRPO00591 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRPO00591 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRPO00591 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRPO00591 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRPO00591 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRPO00591 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRPO00591 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRPO00591 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRPO00591 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRPO00591 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRPO00591 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRPO00591 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRPO00591 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRPO00591 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRPO00591 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRPO00591 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRPO00591 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRPO00591 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRPO00591 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRPO00591 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRPO00591 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRPO00591 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRPO00591 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRPO00591 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRPO00591 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRPO00591 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRPO00591 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRPO00591 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRPO00591 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRPO00591 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRPO00591 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRPO00591 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRPO00591 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRPO00591 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRPO00591 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRPO00591 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRPO00591 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRPO00591 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRPO00591 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRPO00591 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRPO00591 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms