Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KPNA3O00505 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KPNA3O00505 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KPNA3O00505 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA3O00505 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms