Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBXN8O00124 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN8O00124 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms