Protein–RNA interactions for Protein: K7EIQ3

ZNF561-AS1, Uncharacterized protein ZNF561-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561-AS1K7EIQ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF561-AS1K7EIQ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms