Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QKU1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QKU1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
J3QKU1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QKU1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QKU1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QKU1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QKU1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QKU1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QKU1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
J3QKU1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
J3QKU1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QKU1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QKU1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QKU1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QKU1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QKU1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
J3QKU1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QKU1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QKU1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QKU1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QKU1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QKU1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
J3QKU1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QKU1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QKU1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QKU1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QKU1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QKU1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QKU1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
J3QKU1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QKU1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QKU1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QKU1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
J3QKU1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
J3QKU1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QKU1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QKU1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QKU1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QKU1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QKU1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QKU1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QKU1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QKU1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
J3QKU1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
J3QKU1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QKU1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QKU1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QKU1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
J3QKU1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QKU1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QKU1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QKU1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
J3QKU1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QKU1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QKU1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QKU1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QKU1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QKU1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QKU1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QKU1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QKU1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QKU1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QKU1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
J3QKU1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QKU1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QKU1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QKU1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QKU1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QKU1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QKU1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
J3QKU1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QKU1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QKU1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QKU1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
J3QKU1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QKU1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QKU1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QKU1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
J3QKU1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QKU1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QKU1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QKU1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QKU1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QKU1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
J3QKU1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QKU1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QKU1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QKU1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QKU1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QKU1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QKU1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QKU1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QKU1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QKU1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QKU1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QKU1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QKU1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QKU1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
J3QKU1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms