Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC01387J3KSC0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01387J3KSC0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms