Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BNH8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BNH8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BNH8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNH8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNH8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNH8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNH8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNH8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNH8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNH8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNH8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNH8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNH8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BNH8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BNH8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BNH8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BNH8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BNH8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BNH8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BNH8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BNH8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BNH8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BNH8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BNH8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BNH8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BNH8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BNH8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BNH8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BNH8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BNH8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BNH8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BNH8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BNH8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BNH8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BNH8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BNH8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BNH8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BNH8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BNH8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BNH8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BNH8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BNH8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BNH8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BNH8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BNH8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BNH8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BNH8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BNH8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BNH8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BNH8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BNH8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BNH8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BNH8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H3BNH8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNH8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNH8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNH8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNH8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNH8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BNH8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BNH8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BNH8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNH8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNH8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNH8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNH8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNH8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNH8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNH8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNH8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNH8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNH8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BNH8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BNH8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BNH8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BNH8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BNH8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BNH8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BNH8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BNH8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BNH8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BNH8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BNH8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BNH8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BNH8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BNH8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BNH8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BNH8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BNH8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BNH8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BNH8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BNH8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BNH8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BNH8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BNH8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BNH8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BNH8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BNH8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BNH8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms