Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM1B2RUZ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM1B2RUZ4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM1B2RUZ4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms