Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF487B1APH4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF487B1APH4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF487B1APH4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms