Protein–RNA interactions for Protein: A8MTL9

HMSD, Serpin-like protein HMSD, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMSDA8MTL9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMSDA8MTL9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMSDA8MTL9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMSDA8MTL9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HMSDA8MTL9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMSDA8MTL9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMSDA8MTL9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMSDA8MTL9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMSDA8MTL9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms