Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPT2A6NK58 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIPT2A6NK58 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LIPT2A6NK58 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms