Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TVP23AA6NH52 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TVP23AA6NH52 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TVP23AA6NH52 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms