Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
STRCP1A6NGW2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
STRCP1A6NGW2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
STRCP1A6NGW2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
STRCP1A6NGW2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
STRCP1A6NGW2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
STRCP1A6NGW2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
STRCP1A6NGW2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
STRCP1A6NGW2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
STRCP1A6NGW2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
STRCP1A6NGW2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
STRCP1A6NGW2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
STRCP1A6NGW2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
STRCP1A6NGW2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
STRCP1A6NGW2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
STRCP1A6NGW2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
STRCP1A6NGW2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
STRCP1A6NGW2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
STRCP1A6NGW2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
STRCP1A6NGW2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms