Protein–RNA interactions for Protein: A6NDZ8

MBD3L4, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L4A6NDZ8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3L4A6NDZ8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD3L4A6NDZ8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MBD3L4A6NDZ8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD3L4A6NDZ8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3L4A6NDZ8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms