Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP5LA4QPB2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRP5LA4QPB2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRP5LA4QPB2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRP5LA4QPB2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRP5LA4QPB2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRP5LA4QPB2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRP5LA4QPB2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRP5LA4QPB2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms