Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF27A3QJZ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF27A3QJZ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF27A3QJZ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms