Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC162PA2VCL2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC162PA2VCL2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC162PA2VCL2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC162PA2VCL2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms