Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMC3Q9UQE7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMC3Q9UQE7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms