Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCSK1NQ9UHG2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1NQ9UHG2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1NQ9UHG2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1NQ9UHG2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms