Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCHIP1Q9P0W5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCHIP1Q9P0W5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms