Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms