Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRNKL1Q9BZJ0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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